mirror of
https://github.com/HDFGroup/hdf5.git
synced 2025-03-19 16:50:46 +08:00
[svn-r739] Switched ragged array "H5R" API to "H5RA" to make room for the reference API.
This commit is contained in:
Quincey Koziol
parent
deeb5978c0
commit
2c4af336d3
6
MANIFEST
6
MANIFEST
@ -248,9 +248,9 @@
|
||||
./src/H5P.c
|
||||
./src/H5Pprivate.h
|
||||
./src/H5Ppublic.h
|
||||
./src/H5R.c
|
||||
./src/H5Rprivate.h
|
||||
./src/H5Rpublic.h
|
||||
./src/H5RA.c
|
||||
./src/H5RAprivate.h
|
||||
./src/H5RApublic.h
|
||||
./src/H5S.c
|
||||
./src/H5Sall.c
|
||||
./src/H5Shyper.c
|
||||
|
||||
122
src/.distdep
122
src/.distdep
@ -324,39 +324,6 @@ H5Fstdio.o: \
|
||||
H5Dpublic.h \
|
||||
H5MMprivate.h \
|
||||
H5MMpublic.h
|
||||
H5G.o: \
|
||||
H5G.c \
|
||||
H5private.h \
|
||||
H5public.h \
|
||||
H5config.h \
|
||||
H5Aprivate.h \
|
||||
H5Apublic.h \
|
||||
H5Ipublic.h \
|
||||
H5Gprivate.h \
|
||||
H5Gpublic.h \
|
||||
H5Bprivate.h \
|
||||
H5Bpublic.h \
|
||||
H5Fprivate.h \
|
||||
H5Fpublic.h \
|
||||
H5Dpublic.h \
|
||||
H5Dprivate.h \
|
||||
H5Oprivate.h \
|
||||
H5Opublic.h \
|
||||
H5HGprivate.h \
|
||||
H5HGpublic.h \
|
||||
H5Tprivate.h \
|
||||
H5Tpublic.h \
|
||||
H5Sprivate.h \
|
||||
H5Spublic.h \
|
||||
H5Zprivate.h \
|
||||
H5Zpublic.h \
|
||||
H5Eprivate.h \
|
||||
H5Epublic.h \
|
||||
H5Gpkg.h \
|
||||
H5ACprivate.h \
|
||||
H5ACpublic.h \
|
||||
H5HLprivate.h \
|
||||
H5HLpublic.h
|
||||
H5Gent.o: \
|
||||
H5Gent.c \
|
||||
H5private.h \
|
||||
@ -857,34 +824,6 @@ H5P.o: \
|
||||
H5Eprivate.h \
|
||||
H5Epublic.h \
|
||||
H5MMprivate.h
|
||||
H5R.o: \
|
||||
H5R.c \
|
||||
H5Rprivate.h \
|
||||
H5Rpublic.h \
|
||||
H5Ipublic.h \
|
||||
H5public.h \
|
||||
H5config.h \
|
||||
H5Dprivate.h \
|
||||
H5Dpublic.h \
|
||||
H5private.h \
|
||||
H5Fprivate.h \
|
||||
H5Fpublic.h \
|
||||
H5Gprivate.h \
|
||||
H5Gpublic.h \
|
||||
H5Bprivate.h \
|
||||
H5Bpublic.h \
|
||||
H5Oprivate.h \
|
||||
H5Opublic.h \
|
||||
H5HGprivate.h \
|
||||
H5HGpublic.h \
|
||||
H5Tprivate.h \
|
||||
H5Tpublic.h \
|
||||
H5Sprivate.h \
|
||||
H5Spublic.h \
|
||||
H5Zprivate.h \
|
||||
H5Zpublic.h \
|
||||
H5Eprivate.h \
|
||||
H5Epublic.h
|
||||
H5S.o: \
|
||||
H5S.c \
|
||||
H5private.h \
|
||||
@ -1183,3 +1122,64 @@ H5Z.o: \
|
||||
H5Spublic.h \
|
||||
H5Zprivate.h \
|
||||
H5Zpublic.h
|
||||
H5G.o: \
|
||||
H5G.c \
|
||||
H5private.h \
|
||||
H5public.h \
|
||||
H5config.h \
|
||||
H5Aprivate.h \
|
||||
H5Apublic.h \
|
||||
H5Ipublic.h \
|
||||
H5Gprivate.h \
|
||||
H5Gpublic.h \
|
||||
H5Bprivate.h \
|
||||
H5Bpublic.h \
|
||||
H5Fprivate.h \
|
||||
H5Fpublic.h \
|
||||
H5Dpublic.h \
|
||||
H5Dprivate.h \
|
||||
H5Oprivate.h \
|
||||
H5Opublic.h \
|
||||
H5HGprivate.h \
|
||||
H5HGpublic.h \
|
||||
H5Tprivate.h \
|
||||
H5Tpublic.h \
|
||||
H5Sprivate.h \
|
||||
H5Spublic.h \
|
||||
H5Zprivate.h \
|
||||
H5Zpublic.h \
|
||||
H5Eprivate.h \
|
||||
H5Epublic.h \
|
||||
H5Gpkg.h \
|
||||
H5ACprivate.h \
|
||||
H5ACpublic.h \
|
||||
H5HLprivate.h \
|
||||
H5HLpublic.h
|
||||
H5RA.o: \
|
||||
H5RA.c \
|
||||
H5RAprivate.h \
|
||||
H5RApublic.h \
|
||||
H5Ipublic.h \
|
||||
H5public.h \
|
||||
H5config.h \
|
||||
H5Dprivate.h \
|
||||
H5Dpublic.h \
|
||||
H5private.h \
|
||||
H5Fprivate.h \
|
||||
H5Fpublic.h \
|
||||
H5Gprivate.h \
|
||||
H5Gpublic.h \
|
||||
H5Bprivate.h \
|
||||
H5Bpublic.h \
|
||||
H5Oprivate.h \
|
||||
H5Opublic.h \
|
||||
H5HGprivate.h \
|
||||
H5HGpublic.h \
|
||||
H5Tprivate.h \
|
||||
H5Tpublic.h \
|
||||
H5Sprivate.h \
|
||||
H5Spublic.h \
|
||||
H5Zprivate.h \
|
||||
H5Zpublic.h \
|
||||
H5Eprivate.h \
|
||||
H5Epublic.h
|
||||
|
||||
@ -84,7 +84,7 @@
|
||||
#include <H5Iprivate.h>
|
||||
#include <H5MMprivate.h>
|
||||
#include <H5Oprivate.h>
|
||||
#include <H5Rprivate.h>
|
||||
#include <H5RAprivate.h>
|
||||
|
||||
#define H5G_INIT_HEAP 8192
|
||||
#define H5G_RESERVED_ATOMS 0
|
||||
@ -1863,7 +1863,7 @@ H5G_loc (hid_t loc_id)
|
||||
H5T_t *dt=NULL;
|
||||
H5D_t *dset=NULL;
|
||||
H5A_t *attr=NULL;
|
||||
H5R_t *ra=NULL;
|
||||
H5RA_t *ra=NULL;
|
||||
|
||||
FUNC_ENTER (H5G_loc, NULL);
|
||||
|
||||
@ -1951,7 +1951,7 @@ H5G_loc (hid_t loc_id)
|
||||
HRETURN_ERROR(H5E_ARGS, H5E_BADVALUE, NULL,
|
||||
"invalid ragged array ID");
|
||||
}
|
||||
if (NULL==(ret_value=H5R_entof(ra))) {
|
||||
if (NULL==(ret_value=H5RA_entof(ra))) {
|
||||
HRETURN_ERROR(H5E_ARGS, H5E_BADVALUE, NULL,
|
||||
"unable to get symbol table entry of ragged array");
|
||||
}
|
||||
|
||||
@ -25,7 +25,7 @@
|
||||
* dataset. All three datasets are contained in a single group
|
||||
* whose name is the name of the ragged array.
|
||||
*/
|
||||
#include <H5Rprivate.h>
|
||||
#include <H5RAprivate.h>
|
||||
|
||||
#include <H5private.h>
|
||||
#include <H5Eprivate.h>
|
||||
@ -33,32 +33,32 @@
|
||||
#include <H5MMprivate.h>
|
||||
#include <H5Pprivate.h>
|
||||
|
||||
typedef struct H5R_meta_t {
|
||||
typedef struct H5RA_meta_t {
|
||||
hsize_t nelmts; /*num elements in row */
|
||||
hssize_t offset; /*offset into overflow array */
|
||||
hsize_t nover; /*allocated size in overflow array */
|
||||
} H5R_meta_t;
|
||||
} H5RA_meta_t;
|
||||
|
||||
struct H5R_t {
|
||||
struct H5RA_t {
|
||||
H5G_t *group; /*the group containing everything */
|
||||
H5D_t *meta; /*ragged meta data array */
|
||||
H5D_t *raw; /*fixed-width raw data */
|
||||
H5D_t *over; /*overflow data */
|
||||
};
|
||||
|
||||
#define PABLO_MASK H5R_mask
|
||||
#define PABLO_MASK H5RA_mask
|
||||
static hbool_t interface_initialize_g = FALSE;
|
||||
#define INTERFACE_INIT H5R_init_interface
|
||||
static herr_t H5R_init_interface(void);
|
||||
static void H5R_term_interface(void);
|
||||
static H5T_t *H5R_meta_type_g = NULL;
|
||||
#define INTERFACE_INIT H5RA_init_interface
|
||||
static herr_t H5RA_init_interface(void);
|
||||
static void H5RA_term_interface(void);
|
||||
static H5T_t *H5RA_meta_type_g = NULL;
|
||||
|
||||
static herr_t H5R_fix_overflow(H5R_t *ra, H5T_t *type, H5R_meta_t *meta,
|
||||
static herr_t H5RA_fix_overflow(H5RA_t *ra, H5T_t *type, H5RA_meta_t *meta,
|
||||
hsize_t nelmts, void *buf);
|
||||
|
||||
|
||||
/*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
* Function: H5R_init_interface
|
||||
* Function: H5RA_init_interface
|
||||
*
|
||||
* Purpose: Initialize the interface.
|
||||
*
|
||||
@ -74,38 +74,38 @@ static herr_t H5R_fix_overflow(H5R_t *ra, H5T_t *type, H5R_meta_t *meta,
|
||||
*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
*/
|
||||
static herr_t
|
||||
H5R_init_interface(void)
|
||||
H5RA_init_interface(void)
|
||||
{
|
||||
herr_t ret_value = SUCCEED;
|
||||
H5T_t *type = NULL;
|
||||
|
||||
FUNC_ENTER(H5R_init_interface, FAIL);
|
||||
FUNC_ENTER(H5RA_init_interface, FAIL);
|
||||
|
||||
/* The atom group */
|
||||
if ((ret_value=H5I_init_group(H5I_RAGGED, H5I_RAGGED_HASHSIZE, 0,
|
||||
(herr_t(*)(void*))H5R_close))>=0) {
|
||||
ret_value = H5_add_exit(H5R_term_interface);
|
||||
(herr_t(*)(void*))H5RA_close))>=0) {
|
||||
ret_value = H5_add_exit(H5RA_term_interface);
|
||||
}
|
||||
|
||||
/* The meta dataset type */
|
||||
if (NULL==(type=H5T_create(H5T_COMPOUND, sizeof(H5R_meta_t))) ||
|
||||
H5T_insert(type, "nelmts", HOFFSET(H5R_meta_t, nelmts),
|
||||
if (NULL==(type=H5T_create(H5T_COMPOUND, sizeof(H5RA_meta_t))) ||
|
||||
H5T_insert(type, "nelmts", HOFFSET(H5RA_meta_t, nelmts),
|
||||
0, NULL, NULL, H5I_object(H5T_NATIVE_HSIZE_g))<0 ||
|
||||
H5T_insert(type, "offset", HOFFSET(H5R_meta_t, offset),
|
||||
H5T_insert(type, "offset", HOFFSET(H5RA_meta_t, offset),
|
||||
0, NULL, NULL, H5I_object(H5T_NATIVE_HSSIZE_g))<0 ||
|
||||
H5T_insert(type, "nover", HOFFSET(H5R_meta_t, nover),
|
||||
H5T_insert(type, "nover", HOFFSET(H5RA_meta_t, nover),
|
||||
0, NULL, NULL, H5I_object(H5T_NATIVE_HSIZE_g))) {
|
||||
HRETURN_ERROR(H5E_RAGGED, H5E_CANTINIT, FAIL,
|
||||
"unable to define ragged array meta type");
|
||||
}
|
||||
H5R_meta_type_g = type;
|
||||
H5RA_meta_type_g = type;
|
||||
|
||||
FUNC_LEAVE(ret_value);
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
||||
/*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
* Function: H5R_term_interface
|
||||
* Function: H5RA_term_interface
|
||||
*
|
||||
* Purpose: Terminate the ragged array interface.
|
||||
*
|
||||
@ -119,16 +119,16 @@ H5R_init_interface(void)
|
||||
*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
*/
|
||||
static void
|
||||
H5R_term_interface(void)
|
||||
H5RA_term_interface(void)
|
||||
{
|
||||
H5I_destroy_group(H5I_RAGGED);
|
||||
H5T_close(H5R_meta_type_g);
|
||||
H5R_meta_type_g = NULL;
|
||||
H5T_close(H5RA_meta_type_g);
|
||||
H5RA_meta_type_g = NULL;
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
||||
/*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
* Function: H5Rcreate
|
||||
* Function: H5RAcreate
|
||||
*
|
||||
* Purpose: Create a new ragged array with the specified name. A ragged
|
||||
* array is implemented as a group containing three datasets.
|
||||
@ -158,15 +158,15 @@ H5R_term_interface(void)
|
||||
*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
*/
|
||||
hid_t
|
||||
H5Rcreate(hid_t loc_id, const char *name, hid_t type_id, hid_t plist_id)
|
||||
H5RAcreate(hid_t loc_id, const char *name, hid_t type_id, hid_t plist_id)
|
||||
{
|
||||
H5R_t *ra=NULL;
|
||||
H5RA_t *ra=NULL;
|
||||
H5G_entry_t *loc=NULL;
|
||||
H5T_t *type=NULL;
|
||||
const H5D_create_t *plist=NULL;
|
||||
hid_t ret_value=FAIL;
|
||||
|
||||
FUNC_ENTER(H5Rcreate, FAIL);
|
||||
FUNC_ENTER(H5RAcreate, FAIL);
|
||||
H5TRACE4("i","isii",loc_id,name,type_id,plist_id);
|
||||
|
||||
/* Check args */
|
||||
@ -197,14 +197,14 @@ H5Rcreate(hid_t loc_id, const char *name, hid_t type_id, hid_t plist_id)
|
||||
}
|
||||
|
||||
/* Do the real work */
|
||||
if (NULL==(ra=H5R_create(loc, name, type, plist))) {
|
||||
if (NULL==(ra=H5RA_create(loc, name, type, plist))) {
|
||||
HRETURN_ERROR(H5E_RAGGED, H5E_CANTINIT, FAIL,
|
||||
"unable to create ragged array");
|
||||
}
|
||||
|
||||
/* Register the new dataset to get an ID for it */
|
||||
if ((ret_value=H5I_register(H5I_RAGGED, ra))<0) {
|
||||
H5R_close(ra);
|
||||
H5RA_close(ra);
|
||||
HRETURN_ERROR(H5E_RAGGED, H5E_CANTREGISTER, FAIL,
|
||||
"unable to register ragged array");
|
||||
}
|
||||
@ -214,7 +214,7 @@ H5Rcreate(hid_t loc_id, const char *name, hid_t type_id, hid_t plist_id)
|
||||
|
||||
|
||||
/*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
* Function: H5R_create
|
||||
* Function: H5RA_create
|
||||
*
|
||||
* Purpose: Create a new ragged array implemented as a group.
|
||||
*
|
||||
@ -229,18 +229,18 @@ H5Rcreate(hid_t loc_id, const char *name, hid_t type_id, hid_t plist_id)
|
||||
*
|
||||
*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
*/
|
||||
H5R_t *
|
||||
H5R_create(H5G_entry_t *loc, const char *name, H5T_t *type,
|
||||
H5RA_t *
|
||||
H5RA_create(H5G_entry_t *loc, const char *name, H5T_t *type,
|
||||
const H5D_create_t *dcpl)
|
||||
{
|
||||
H5R_t *ra = NULL;
|
||||
H5RA_t *ra = NULL;
|
||||
H5S_t *space = NULL;
|
||||
hsize_t cur_dims[2];
|
||||
hsize_t max_dims[2];
|
||||
H5R_t *ret_value=NULL;
|
||||
H5RA_t *ret_value=NULL;
|
||||
H5D_create_t d1_dcpl;
|
||||
|
||||
FUNC_ENTER(H5R_create, NULL);
|
||||
FUNC_ENTER(H5RA_create, NULL);
|
||||
|
||||
/* Check args */
|
||||
assert(loc);
|
||||
@ -250,7 +250,7 @@ H5R_create(H5G_entry_t *loc, const char *name, H5T_t *type,
|
||||
assert(H5D_CHUNKED==dcpl->layout);
|
||||
|
||||
/* Create the data struct */
|
||||
if (NULL==(ra=H5MM_calloc(sizeof(H5R_t)))) {
|
||||
if (NULL==(ra=H5MM_calloc(sizeof(H5RA_t)))) {
|
||||
HGOTO_ERROR(H5E_RESOURCE, H5E_NOSPACE, NULL,
|
||||
"memory allocation failed for ragged array struct");
|
||||
}
|
||||
@ -316,9 +316,9 @@ H5R_create(H5G_entry_t *loc, const char *name, H5T_t *type,
|
||||
d1_dcpl.chunk_size[0] = MAX(1,
|
||||
(dcpl->chunk_size[0]*dcpl->chunk_size[1]*
|
||||
H5T_get_size(type))/
|
||||
H5T_get_size(H5R_meta_type_g));
|
||||
H5T_get_size(H5RA_meta_type_g));
|
||||
if (NULL==(ra->meta=H5D_create(H5G_entof(ra->group), "meta",
|
||||
H5R_meta_type_g, space, &d1_dcpl))) {
|
||||
H5RA_meta_type_g, space, &d1_dcpl))) {
|
||||
HGOTO_ERROR(H5E_RAGGED, H5E_CANTINIT, NULL,
|
||||
"unable to create meta dataset");
|
||||
}
|
||||
@ -347,7 +347,7 @@ H5R_create(H5G_entry_t *loc, const char *name, H5T_t *type,
|
||||
|
||||
|
||||
/*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
* Function: H5Ropen
|
||||
* Function: H5RAopen
|
||||
*
|
||||
* Purpose: Opens an existing ragged array. The name of the array should
|
||||
* be the same that was used when the array was created; that is,
|
||||
@ -365,13 +365,13 @@ H5R_create(H5G_entry_t *loc, const char *name, H5T_t *type,
|
||||
*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
*/
|
||||
hid_t
|
||||
H5Ropen(hid_t loc_id, const char *name)
|
||||
H5RAopen(hid_t loc_id, const char *name)
|
||||
{
|
||||
H5G_entry_t *loc=NULL;
|
||||
H5R_t *ra=NULL;
|
||||
H5RA_t *ra=NULL;
|
||||
hid_t ret_value=FAIL;
|
||||
|
||||
FUNC_ENTER(H5Ropen, FAIL);
|
||||
FUNC_ENTER(H5RAopen, FAIL);
|
||||
H5TRACE2("i","is",loc_id,name);
|
||||
|
||||
/* Check args */
|
||||
@ -383,14 +383,14 @@ H5Ropen(hid_t loc_id, const char *name)
|
||||
}
|
||||
|
||||
/* The real work */
|
||||
if (NULL==(ra=H5R_open(loc, name))) {
|
||||
if (NULL==(ra=H5RA_open(loc, name))) {
|
||||
HRETURN_ERROR(H5E_RAGGED, H5E_CANTOPENOBJ, FAIL,
|
||||
"unable to open ragged array");
|
||||
}
|
||||
|
||||
/* Turn it into an atom */
|
||||
if ((ret_value=H5I_register(H5I_RAGGED, ra))<0) {
|
||||
H5R_close(ra);
|
||||
H5RA_close(ra);
|
||||
HRETURN_ERROR(H5E_RAGGED, H5E_CANTREGISTER, FAIL,
|
||||
"unable to register ragged array");
|
||||
}
|
||||
@ -400,7 +400,7 @@ H5Ropen(hid_t loc_id, const char *name)
|
||||
|
||||
|
||||
/*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
* Function: H5R_open
|
||||
* Function: H5RA_open
|
||||
*
|
||||
* Purpose: Open a ragged array. The name of the array is the same as
|
||||
* the group that implements the array.
|
||||
@ -416,20 +416,20 @@ H5Ropen(hid_t loc_id, const char *name)
|
||||
*
|
||||
*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
*/
|
||||
H5R_t *
|
||||
H5R_open(H5G_entry_t *loc, const char *name)
|
||||
H5RA_t *
|
||||
H5RA_open(H5G_entry_t *loc, const char *name)
|
||||
{
|
||||
H5R_t *ra = NULL;
|
||||
H5R_t *ret_value = NULL;
|
||||
H5RA_t *ra = NULL;
|
||||
H5RA_t *ret_value = NULL;
|
||||
|
||||
FUNC_ENTER(H5R_open, NULL);
|
||||
FUNC_ENTER(H5RA_open, NULL);
|
||||
|
||||
/* Check arguments */
|
||||
assert(loc);
|
||||
assert(name && *name);
|
||||
|
||||
/* Create the struct */
|
||||
if (NULL==(ra=H5MM_calloc(sizeof(H5R_t)))) {
|
||||
if (NULL==(ra=H5MM_calloc(sizeof(H5RA_t)))) {
|
||||
HGOTO_ERROR(H5E_RESOURCE, H5E_NOSPACE, NULL,
|
||||
"memory allocation failed for ragged array struct");
|
||||
}
|
||||
@ -465,7 +465,7 @@ H5R_open(H5G_entry_t *loc, const char *name)
|
||||
|
||||
|
||||
/*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
* Function: H5Rclose
|
||||
* Function: H5RAclose
|
||||
*
|
||||
* Purpose: Close a ragged array.
|
||||
*
|
||||
@ -481,11 +481,11 @@ H5R_open(H5G_entry_t *loc, const char *name)
|
||||
*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
*/
|
||||
herr_t
|
||||
H5Rclose(hid_t array_id)
|
||||
H5RAclose(hid_t array_id)
|
||||
{
|
||||
H5R_t *ra=NULL;
|
||||
H5RA_t *ra=NULL;
|
||||
|
||||
FUNC_ENTER(H5Rclose, FAIL);
|
||||
FUNC_ENTER(H5RAclose, FAIL);
|
||||
H5TRACE1("e","i",array_id);
|
||||
|
||||
/* Check args */
|
||||
@ -507,7 +507,7 @@ H5Rclose(hid_t array_id)
|
||||
|
||||
|
||||
/*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
* Function: H5R_close
|
||||
* Function: H5RA_close
|
||||
*
|
||||
* Purpose: Close a ragged array
|
||||
*
|
||||
@ -523,9 +523,9 @@ H5Rclose(hid_t array_id)
|
||||
*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
*/
|
||||
herr_t
|
||||
H5R_close(H5R_t *ra)
|
||||
H5RA_close(H5RA_t *ra)
|
||||
{
|
||||
FUNC_ENTER(H5R_close, FAIL);
|
||||
FUNC_ENTER(H5RA_close, FAIL);
|
||||
|
||||
assert(ra);
|
||||
if ((ra->group && H5G_close(ra->group)<0) ||
|
||||
@ -535,7 +535,7 @@ H5R_close(H5R_t *ra)
|
||||
HRETURN_ERROR(H5E_RAGGED, H5E_CANTINIT, FAIL,
|
||||
"unable to close one or more component datasets");
|
||||
}
|
||||
HDmemset(ra, 0, sizeof(H5R_t));
|
||||
HDmemset(ra, 0, sizeof(H5RA_t));
|
||||
H5MM_xfree(ra);
|
||||
|
||||
FUNC_LEAVE(SUCCEED);
|
||||
@ -543,7 +543,7 @@ H5R_close(H5R_t *ra)
|
||||
|
||||
|
||||
/*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
* Function: H5Rwrite
|
||||
* Function: H5RAwrite
|
||||
*
|
||||
* Purpose: Write a contiguous set of rows to a ragged array beginning at
|
||||
* row number START_ROW and continuing for NROWS rows. Each row
|
||||
@ -562,14 +562,14 @@ H5R_close(H5R_t *ra)
|
||||
*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
*/
|
||||
herr_t
|
||||
H5Rwrite(hid_t array_id, hssize_t start_row, hsize_t nrows,
|
||||
H5RAwrite(hid_t array_id, hssize_t start_row, hsize_t nrows,
|
||||
hid_t type_id, hsize_t size[/*nrows*/], void *buf[/*nrows*/])
|
||||
{
|
||||
H5R_t *ra=NULL;
|
||||
H5RA_t *ra=NULL;
|
||||
H5T_t *type=NULL;
|
||||
hsize_t i;
|
||||
|
||||
FUNC_ENTER(H5Rwrite, FAIL);
|
||||
FUNC_ENTER(H5RAwrite, FAIL);
|
||||
H5TRACE6("e","iHshi*[a2]h*[a2]x",array_id,start_row,nrows,type_id,size,
|
||||
buf);
|
||||
|
||||
@ -596,7 +596,7 @@ H5Rwrite(hid_t array_id, hssize_t start_row, hsize_t nrows,
|
||||
}
|
||||
|
||||
/* Do the work */
|
||||
if (H5R_write(ra, start_row, nrows, type, size, buf)<0) {
|
||||
if (H5RA_write(ra, start_row, nrows, type, size, buf)<0) {
|
||||
HRETURN_ERROR(H5E_RAGGED, H5E_WRITEERROR, FAIL,
|
||||
"unable to write to ragged array");
|
||||
}
|
||||
@ -606,7 +606,7 @@ H5Rwrite(hid_t array_id, hssize_t start_row, hsize_t nrows,
|
||||
|
||||
|
||||
/*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
* Function: H5R_write
|
||||
* Function: H5RA_write
|
||||
*
|
||||
* Purpose: Write a contiguous set of rows to a ragged array beginning at
|
||||
* row number START_ROW and continuing for NROWS rows. Each row
|
||||
@ -625,11 +625,11 @@ H5Rwrite(hid_t array_id, hssize_t start_row, hsize_t nrows,
|
||||
*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
*/
|
||||
herr_t
|
||||
H5R_write(H5R_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
H5RA_write(H5RA_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
hsize_t size[], void *buf[])
|
||||
{
|
||||
herr_t ret_value=FAIL;
|
||||
H5R_meta_t *meta = NULL;
|
||||
H5RA_meta_t *meta = NULL;
|
||||
H5S_t *mf_space=NULL; /*meta file data space */
|
||||
H5S_t *mm_space=NULL; /*meta memory data space */
|
||||
H5S_t *rf_space=NULL; /*raw data file space */
|
||||
@ -643,7 +643,7 @@ H5R_write(H5R_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
size_t type_size; /*size of the TYPE argument */
|
||||
hsize_t i;
|
||||
|
||||
FUNC_ENTER(H5R_write, FAIL);
|
||||
FUNC_ENTER(H5RA_write, FAIL);
|
||||
|
||||
/* Check args */
|
||||
assert(ra);
|
||||
@ -671,17 +671,17 @@ H5R_write(H5R_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
HGOTO_ERROR(H5E_RAGGED, H5E_CANTINIT, FAIL,
|
||||
"unable to set meta data selection");
|
||||
}
|
||||
if (NULL==(meta=H5MM_malloc(nrows*sizeof(H5R_meta_t)))) {
|
||||
if (NULL==(meta=H5MM_malloc(nrows*sizeof(H5RA_meta_t)))) {
|
||||
HGOTO_ERROR(H5E_RESOURCE, H5E_NOSPACE, FAIL,
|
||||
"memory allocation failed for meta data");
|
||||
}
|
||||
if (H5D_read(ra->meta, H5R_meta_type_g, mm_space, mf_space,
|
||||
if (H5D_read(ra->meta, H5RA_meta_type_g, mm_space, mf_space,
|
||||
&H5D_xfer_dflt, meta)<0) {
|
||||
HGOTO_ERROR(H5E_RAGGED, H5E_READERROR, FAIL,
|
||||
"unable to read meta data");
|
||||
}
|
||||
HDmemset(meta+meta_read_size, 0,
|
||||
(nrows-meta_read_size)*sizeof(H5R_meta_t));
|
||||
(nrows-meta_read_size)*sizeof(H5RA_meta_t));
|
||||
|
||||
/* Write the part of the data that will fit in the raw dataset */
|
||||
if (NULL==(rf_space=H5D_get_space(ra->raw)) ||
|
||||
@ -726,7 +726,7 @@ H5R_write(H5R_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
/* Update the meta data */
|
||||
for (i=0; i<nrows; i++) {
|
||||
if (size[i]>raw_cur_size[1]) {
|
||||
H5R_fix_overflow(ra, type, meta+i, size[i]-raw_cur_size[1],
|
||||
H5RA_fix_overflow(ra, type, meta+i, size[i]-raw_cur_size[1],
|
||||
(uint8*)(buf[i])+raw_cur_size[1]*type_size);
|
||||
}
|
||||
meta[i].nelmts = size[i];
|
||||
@ -746,7 +746,7 @@ H5R_write(H5R_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
HGOTO_ERROR(H5E_RAGGED, H5E_CANTINIT, FAIL,
|
||||
"unable to set meta data selection");
|
||||
}
|
||||
if (H5D_write(ra->meta, H5R_meta_type_g, mm_space, mf_space,
|
||||
if (H5D_write(ra->meta, H5RA_meta_type_g, mm_space, mf_space,
|
||||
&H5D_xfer_dflt, meta)<0) {
|
||||
HGOTO_ERROR(H5E_RAGGED, H5E_WRITEERROR, FAIL,
|
||||
"unable to write meta data");
|
||||
@ -766,7 +766,7 @@ H5R_write(H5R_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
|
||||
|
||||
/*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
* Function: H5R_fix_overflow
|
||||
* Function: H5RA_fix_overflow
|
||||
*
|
||||
* Purpose: Updates the overflow information for a row. This is where
|
||||
* the heap management comes into play. The NELMTS is the
|
||||
@ -786,7 +786,7 @@ H5R_write(H5R_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
*/
|
||||
static herr_t
|
||||
H5R_fix_overflow(H5R_t *ra, H5T_t *type, H5R_meta_t *meta, hsize_t nelmts,
|
||||
H5RA_fix_overflow(H5RA_t *ra, H5T_t *type, H5RA_meta_t *meta, hsize_t nelmts,
|
||||
void *buf)
|
||||
{
|
||||
H5S_t *of_space=NULL; /*overflow file space */
|
||||
@ -794,7 +794,7 @@ H5R_fix_overflow(H5R_t *ra, H5T_t *type, H5R_meta_t *meta, hsize_t nelmts,
|
||||
hsize_t cur_size; /*num elmts in overflow dataset */
|
||||
herr_t ret_value=FAIL; /*return value */
|
||||
|
||||
FUNC_ENTER(H5R_fix_overflow, FAIL);
|
||||
FUNC_ENTER(H5RA_fix_overflow, FAIL);
|
||||
|
||||
assert(ra);
|
||||
assert(meta);
|
||||
@ -887,7 +887,7 @@ H5R_fix_overflow(H5R_t *ra, H5T_t *type, H5R_meta_t *meta, hsize_t nelmts,
|
||||
|
||||
|
||||
/*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
* Function: H5Rread
|
||||
* Function: H5RAread
|
||||
*
|
||||
* Purpose: Reads the contents of one or more rows of a ragged array
|
||||
* pointed to by ARRAY_ID. The rows to read begin at row
|
||||
@ -924,13 +924,13 @@ H5R_fix_overflow(H5R_t *ra, H5T_t *type, H5R_meta_t *meta, hsize_t nelmts,
|
||||
*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
*/
|
||||
herr_t
|
||||
H5Rread(hid_t array_id, hssize_t start_row, hsize_t nrows,
|
||||
H5RAread(hid_t array_id, hssize_t start_row, hsize_t nrows,
|
||||
hid_t type_id, hsize_t size[/*nrows*/], void *buf[/*nrows*/])
|
||||
{
|
||||
H5R_t *ra=NULL;
|
||||
H5RA_t *ra=NULL;
|
||||
H5T_t *type=NULL;
|
||||
|
||||
FUNC_ENTER(H5Rread, FAIL);
|
||||
FUNC_ENTER(H5RAread, FAIL);
|
||||
H5TRACE6("e","iHshi*[a2]h*[a2]x",array_id,start_row,nrows,type_id,size,
|
||||
buf);
|
||||
|
||||
@ -951,7 +951,7 @@ H5Rread(hid_t array_id, hssize_t start_row, hsize_t nrows,
|
||||
}
|
||||
|
||||
/* Do the work */
|
||||
if (H5R_read(ra, start_row, nrows, type, size, buf)<0) {
|
||||
if (H5RA_read(ra, start_row, nrows, type, size, buf)<0) {
|
||||
HRETURN_ERROR(H5E_RAGGED, H5E_READERROR, FAIL,
|
||||
"unable to read ragged array");
|
||||
}
|
||||
@ -961,9 +961,9 @@ H5Rread(hid_t array_id, hssize_t start_row, hsize_t nrows,
|
||||
|
||||
|
||||
/*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
* Function: H5R_read
|
||||
* Function: H5RA_read
|
||||
*
|
||||
* Purpose: Reads (part of) a ragged array. See H5Rread() for details.
|
||||
* Purpose: Reads (part of) a ragged array. See H5RAread() for details.
|
||||
*
|
||||
* Return: Success: SUCCEED
|
||||
*
|
||||
@ -977,11 +977,11 @@ H5Rread(hid_t array_id, hssize_t start_row, hsize_t nrows,
|
||||
*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
*/
|
||||
herr_t
|
||||
H5R_read(H5R_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
H5RA_read(H5RA_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
hsize_t size[], void *buf[])
|
||||
{
|
||||
herr_t ret_value=FAIL;
|
||||
H5R_meta_t *meta = NULL;
|
||||
H5RA_meta_t *meta = NULL;
|
||||
H5S_t *mf_space=NULL; /*meta file data space */
|
||||
H5S_t *mm_space=NULL; /*meta memory data space */
|
||||
H5S_t *rf_space=NULL; /*raw data file space */
|
||||
@ -999,7 +999,7 @@ H5R_read(H5R_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
void **buf_out=NULL; /*output BUF values */
|
||||
hsize_t i; /*counter */
|
||||
|
||||
FUNC_ENTER(H5R_read, FAIL);
|
||||
FUNC_ENTER(H5RA_read, FAIL);
|
||||
|
||||
/* Check args */
|
||||
assert(ra);
|
||||
@ -1054,7 +1054,7 @@ H5R_read(H5R_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
(nrows-raw_read_size[0])*raw_read_size[1]*type_size);
|
||||
|
||||
/* Get the meta data */
|
||||
if (NULL==(meta=H5MM_malloc(nrows*sizeof(H5R_meta_t)))) {
|
||||
if (NULL==(meta=H5MM_malloc(nrows*sizeof(H5RA_meta_t)))) {
|
||||
HGOTO_ERROR(H5E_RESOURCE, H5E_NOSPACE, FAIL,
|
||||
"memory allocation failed for meta data");
|
||||
}
|
||||
@ -1075,13 +1075,13 @@ H5R_read(H5R_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
HGOTO_ERROR(H5E_RAGGED, H5E_CANTINIT, FAIL,
|
||||
"unable to set meta data selection");
|
||||
}
|
||||
if (H5D_read(ra->meta, H5R_meta_type_g, mm_space, mf_space,
|
||||
if (H5D_read(ra->meta, H5RA_meta_type_g, mm_space, mf_space,
|
||||
&H5D_xfer_dflt, meta)<0) {
|
||||
HGOTO_ERROR(H5E_RAGGED, H5E_READERROR, FAIL,
|
||||
"unable to read meta data");
|
||||
}
|
||||
HDmemset(meta+meta_read_size, 0,
|
||||
(nrows-meta_read_size)*sizeof(H5R_meta_t));
|
||||
(nrows-meta_read_size)*sizeof(H5RA_meta_t));
|
||||
|
||||
/* Copy data into output buffers */
|
||||
for (i=0; i<nrows; i++) {
|
||||
@ -1166,7 +1166,7 @@ H5R_read(H5R_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
|
||||
|
||||
/*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
* Function: H5R_entof
|
||||
* Function: H5RA_entof
|
||||
*
|
||||
* Purpose: Return a pointer to the ragged arrays symbol table entry.
|
||||
*
|
||||
@ -1182,7 +1182,7 @@ H5R_read(H5R_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
*-------------------------------------------------------------------------
|
||||
*/
|
||||
H5G_entry_t *
|
||||
H5R_entof(H5R_t *ra)
|
||||
H5RA_entof(H5RA_t *ra)
|
||||
{
|
||||
assert(ra);
|
||||
return H5G_entof(ra->group);
|
||||
28
src/H5RAprivate.h
Normal file
28
src/H5RAprivate.h
Normal file
@ -0,0 +1,28 @@
|
||||
/*
|
||||
* Copyright © 1998 NCSA
|
||||
* All rights reserved.
|
||||
*
|
||||
* Programmer: Robb Matzke <matzke@llnl.gov>
|
||||
* Tuesday, August 25, 1998
|
||||
*/
|
||||
#ifndef _H5RAprivate_H
|
||||
#define _H5RAprivate_H
|
||||
#include <H5RApublic.h>
|
||||
|
||||
#include <H5Dprivate.h>
|
||||
#include <H5Gprivate.h>
|
||||
#include <H5Tprivate.h>
|
||||
|
||||
typedef struct H5RA_t H5RA_t;
|
||||
|
||||
herr_t H5RA_close(H5RA_t *ra);
|
||||
H5RA_t *H5RA_create(H5G_entry_t *loc, const char *name, H5T_t *type,
|
||||
const H5D_create_t *dcpl);
|
||||
H5RA_t *H5RA_open(H5G_entry_t *loc, const char *name);
|
||||
herr_t H5RA_write(H5RA_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
hsize_t size[], void *buf[]);
|
||||
herr_t H5RA_read(H5RA_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
hsize_t size[], void *buf[]);
|
||||
H5G_entry_t *H5RA_entof(H5RA_t *ra);
|
||||
|
||||
#endif
|
||||
@ -5,8 +5,8 @@
|
||||
* Programmer: Robb Matzke <matzke@llnl.gov>
|
||||
* Tuesday, August 25, 1998
|
||||
*/
|
||||
#ifndef _H5Rpublic_H
|
||||
#define _H5Rpublic_H
|
||||
#ifndef _H5RApublic_H
|
||||
#define _H5RApublic_H
|
||||
|
||||
#include <H5Ipublic.h>
|
||||
|
||||
@ -14,12 +14,12 @@
|
||||
extern "C" {
|
||||
#endif
|
||||
|
||||
hid_t H5Rcreate(hid_t loc_id, const char *name, hid_t type_id, hid_t plist_id);
|
||||
hid_t H5Ropen(hid_t loc_id, const char *name);
|
||||
herr_t H5Rclose(hid_t array_id);
|
||||
herr_t H5Rwrite(hid_t array_id, hssize_t start_row, hsize_t nrows,
|
||||
hid_t H5RAcreate(hid_t loc_id, const char *name, hid_t type_id, hid_t plist_id);
|
||||
hid_t H5RAopen(hid_t loc_id, const char *name);
|
||||
herr_t H5RAclose(hid_t array_id);
|
||||
herr_t H5RAwrite(hid_t array_id, hssize_t start_row, hsize_t nrows,
|
||||
hid_t type_id, hsize_t size[], void *buf[]);
|
||||
herr_t H5Rread(hid_t array_id, hssize_t start_row, hsize_t nrows,
|
||||
herr_t H5RAread(hid_t array_id, hssize_t start_row, hsize_t nrows,
|
||||
hid_t type_id, hsize_t size[], void *buf[]);
|
||||
|
||||
#ifdef __cplusplus
|
||||
@ -1,28 +0,0 @@
|
||||
/*
|
||||
* Copyright © 1998 NCSA
|
||||
* All rights reserved.
|
||||
*
|
||||
* Programmer: Robb Matzke <matzke@llnl.gov>
|
||||
* Tuesday, August 25, 1998
|
||||
*/
|
||||
#ifndef _H5Rprivate_H
|
||||
#define _H5Rprivate_H
|
||||
#include <H5Rpublic.h>
|
||||
|
||||
#include <H5Dprivate.h>
|
||||
#include <H5Gprivate.h>
|
||||
#include <H5Tprivate.h>
|
||||
|
||||
typedef struct H5R_t H5R_t;
|
||||
|
||||
herr_t H5R_close(H5R_t *ra);
|
||||
H5R_t *H5R_create(H5G_entry_t *loc, const char *name, H5T_t *type,
|
||||
const H5D_create_t *dcpl);
|
||||
H5R_t *H5R_open(H5G_entry_t *loc, const char *name);
|
||||
herr_t H5R_write(H5R_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
hsize_t size[], void *buf[]);
|
||||
herr_t H5R_read(H5R_t *ra, hssize_t start_row, hsize_t nrows, H5T_t *type,
|
||||
hsize_t size[], void *buf[]);
|
||||
H5G_entry_t *H5R_entof(H5R_t *ra);
|
||||
|
||||
#endif
|
||||
@ -19,7 +19,7 @@ LIB_SRC=H5.c H5A.c H5AC.c H5B.c H5D.c H5E.c H5F.c H5Farray.c H5Fcore.c \
|
||||
H5Fstdio.c H5G.c H5Gent.c H5Gnode.c H5Gstab.c H5HG.c H5HL.c H5I.c H5MF.c \
|
||||
H5MM.c H5O.c H5Oattr.c H5Ocomp.c H5Ocont.c H5Odtype.c H5Oefl.c H5Ofill.c \
|
||||
H5Olayout.c H5Omtime.c H5Oname.c H5Onull.c H5Osdspace.c H5Oshared.c \
|
||||
H5Ostab.c H5P.c H5R.c H5S.c H5Sall.c H5Shyper.c H5Smpio.c H5Spoint.c \
|
||||
H5Ostab.c H5P.c H5RA.c H5S.c H5Sall.c H5Shyper.c H5Smpio.c H5Spoint.c \
|
||||
H5Sselect.c H5T.c H5Tbit.c H5Tconv.c H5Tinit.c H5TB.c H5V.c H5Z.c
|
||||
|
||||
LIB_OBJ=$(LIB_SRC:.c=.o)
|
||||
@ -31,13 +31,13 @@ MOSTLYCLEAN=H5detect.o H5detect H5Tinit.o H5Tinit.c
|
||||
PUB_HDR=H5public.h H5Apublic.h H5ACpublic.h H5Bpublic.h H5Dpublic.h \
|
||||
H5Epublic.h H5Fpublic.h H5Gpublic.h H5HGpublic.h H5HLpublic.h \
|
||||
H5Ipublic.h H5MFpublic.h H5MMpublic.h H5Opublic.h H5Ppublic.h \
|
||||
H5Rpublic.h H5Spublic.h H5Tpublic.h H5Zpublic.h H5config.h hdf5.h
|
||||
H5RApublic.h H5Spublic.h H5Tpublic.h H5Zpublic.h H5config.h hdf5.h
|
||||
|
||||
# Other header files (not to be installed)...
|
||||
PRIVATE_HDR=H5private.h H5Aprivate.h H5Apkg.h H5ACprivate.h H5Bprivate.h \
|
||||
H5Dprivate.h H5Eprivate.h H5Fprivate.h H5Gprivate.h H5Gpkg.h \
|
||||
H5HGprivate.h H5HLprivate.h H5Iprivate.h H5MFprivate.h H5MMprivate.h \
|
||||
H5Oprivate.h H5Pprivate.h H5Rprivate.h H5Sprivate.h H5Tprivate.h \
|
||||
H5Oprivate.h H5Pprivate.h H5RAprivate.h H5Sprivate.h H5Tprivate.h \
|
||||
H5TBprivate.h H5Tpkg.h H5Vprivate.h H5Zprivate.h
|
||||
|
||||
# Number format detection
|
||||
|
||||
@ -33,7 +33,7 @@
|
||||
#include <H5MMpublic.h> /* Core memory management */
|
||||
#include <H5Opublic.h> /* Object headers */
|
||||
#include <H5Ppublic.h> /* Property lists */
|
||||
#include <H5Rpublic.h> /* Ragged arrays */
|
||||
#include <H5RApublic.h> /* Ragged arrays */
|
||||
#include <H5Spublic.h> /* Dataspaces */
|
||||
#include <H5Tpublic.h> /* Datatypes */
|
||||
#include <H5Zpublic.h> /* Data filters */
|
||||
|
||||
@ -198,7 +198,7 @@ dtypes.o: \
|
||||
../src/H5Opublic.h \
|
||||
../src/H5Ppublic.h \
|
||||
../src/H5Zpublic.h \
|
||||
../src/H5Rpublic.h \
|
||||
../src/H5RApublic.h \
|
||||
../src/H5Spublic.h \
|
||||
../src/H5Tpublic.h \
|
||||
../src/H5Tpkg.h \
|
||||
@ -261,7 +261,7 @@ dsets.o: \
|
||||
../src/H5Opublic.h \
|
||||
../src/H5Ppublic.h \
|
||||
../src/H5Zpublic.h \
|
||||
../src/H5Rpublic.h \
|
||||
../src/H5RApublic.h \
|
||||
../src/H5Spublic.h \
|
||||
../src/H5Tpublic.h
|
||||
cmpd_dset.o: \
|
||||
@ -284,7 +284,7 @@ cmpd_dset.o: \
|
||||
../src/H5Opublic.h \
|
||||
../src/H5Ppublic.h \
|
||||
../src/H5Zpublic.h \
|
||||
../src/H5Rpublic.h \
|
||||
../src/H5RApublic.h \
|
||||
../src/H5Spublic.h \
|
||||
../src/H5Tpublic.h
|
||||
extend.o: \
|
||||
@ -307,7 +307,7 @@ extend.o: \
|
||||
../src/H5Opublic.h \
|
||||
../src/H5Ppublic.h \
|
||||
../src/H5Zpublic.h \
|
||||
../src/H5Rpublic.h
|
||||
../src/H5RApublic.h
|
||||
external.o: \
|
||||
external.c \
|
||||
../src/hdf5.h \
|
||||
@ -328,7 +328,7 @@ external.o: \
|
||||
../src/H5Opublic.h \
|
||||
../src/H5Ppublic.h \
|
||||
../src/H5Zpublic.h \
|
||||
../src/H5Rpublic.h \
|
||||
../src/H5RApublic.h \
|
||||
../src/H5Spublic.h \
|
||||
../src/H5Tpublic.h
|
||||
iopipe.o: \
|
||||
@ -351,7 +351,7 @@ iopipe.o: \
|
||||
../src/H5Opublic.h \
|
||||
../src/H5Ppublic.h \
|
||||
../src/H5Zpublic.h \
|
||||
../src/H5Rpublic.h \
|
||||
../src/H5RApublic.h \
|
||||
../src/H5Spublic.h \
|
||||
../src/H5Tpublic.h
|
||||
gheap.o: \
|
||||
@ -393,7 +393,7 @@ shtype.o: \
|
||||
../src/H5Opublic.h \
|
||||
../src/H5Ppublic.h \
|
||||
../src/H5Zpublic.h \
|
||||
../src/H5Rpublic.h
|
||||
../src/H5RApublic.h
|
||||
big.o: \
|
||||
big.c \
|
||||
../src/hdf5.h \
|
||||
@ -414,7 +414,7 @@ big.o: \
|
||||
../src/H5Opublic.h \
|
||||
../src/H5Ppublic.h \
|
||||
../src/H5Zpublic.h \
|
||||
../src/H5Rpublic.h \
|
||||
../src/H5RApublic.h \
|
||||
../src/H5Spublic.h \
|
||||
../src/H5Tpublic.h \
|
||||
../src/H5private.h
|
||||
@ -438,7 +438,7 @@ links.o: \
|
||||
../src/H5Opublic.h \
|
||||
../src/H5Ppublic.h \
|
||||
../src/H5Zpublic.h \
|
||||
../src/H5Rpublic.h \
|
||||
../src/H5RApublic.h \
|
||||
../src/H5Spublic.h
|
||||
chunk.o: \
|
||||
chunk.c \
|
||||
@ -460,7 +460,7 @@ chunk.o: \
|
||||
../src/H5Opublic.h \
|
||||
../src/H5Ppublic.h \
|
||||
../src/H5Zpublic.h \
|
||||
../src/H5Rpublic.h \
|
||||
../src/H5RApublic.h \
|
||||
../src/H5Spublic.h
|
||||
bittests.o: \
|
||||
bittests.c \
|
||||
@ -498,7 +498,7 @@ mtime.o: \
|
||||
../src/H5Opublic.h \
|
||||
../src/H5Ppublic.h \
|
||||
../src/H5Zpublic.h \
|
||||
../src/H5Rpublic.h \
|
||||
../src/H5RApublic.h \
|
||||
../src/H5Spublic.h \
|
||||
../src/H5Tpublic.h \
|
||||
../src/H5private.h
|
||||
@ -522,7 +522,7 @@ ragged.o: \
|
||||
../src/H5Opublic.h \
|
||||
../src/H5Ppublic.h \
|
||||
../src/H5Zpublic.h \
|
||||
../src/H5Rpublic.h \
|
||||
../src/H5RApublic.h \
|
||||
../src/H5Spublic.h \
|
||||
../src/H5Tpublic.h \
|
||||
../src/H5private.h
|
||||
@ -546,7 +546,7 @@ unlink.o: \
|
||||
../src/H5Opublic.h \
|
||||
../src/H5Ppublic.h \
|
||||
../src/H5Zpublic.h \
|
||||
../src/H5Rpublic.h \
|
||||
../src/H5RApublic.h \
|
||||
../src/H5Spublic.h
|
||||
overhead.o: \
|
||||
overhead.c \
|
||||
@ -568,7 +568,7 @@ overhead.o: \
|
||||
../src/H5Opublic.h \
|
||||
../src/H5Ppublic.h \
|
||||
../src/H5Zpublic.h \
|
||||
../src/H5Rpublic.h \
|
||||
../src/H5RApublic.h \
|
||||
../src/H5Spublic.h \
|
||||
../src/H5Tpublic.h
|
||||
fillval.o: \
|
||||
@ -591,6 +591,6 @@ fillval.o: \
|
||||
../src/H5Opublic.h \
|
||||
../src/H5Ppublic.h \
|
||||
../src/H5Zpublic.h \
|
||||
../src/H5Rpublic.h \
|
||||
../src/H5RApublic.h \
|
||||
../src/H5Spublic.h \
|
||||
../src/H5Tpublic.h
|
||||
|
||||
@ -235,7 +235,7 @@ ragged_write_all(hid_t ra, hsize_t rows_at_once)
|
||||
buf[i] = dd;
|
||||
interval_nelmts += size[i];
|
||||
}
|
||||
if (H5Rwrite(ra, row, i, H_MTYPE, size, buf)<0) goto error;
|
||||
if (H5RAwrite(ra, row, i, H_MTYPE, size, buf)<0) goto error;
|
||||
if (0==row || alarm_g || 0==timeout_g) {
|
||||
alarm_g = 0;
|
||||
H5_timer_end(&timer_total, &timer);
|
||||
@ -333,7 +333,7 @@ ragged_read_all(hid_t ra, hsize_t rows_at_once)
|
||||
/* Clear data then read */
|
||||
HDmemset(size, 0, rows_at_once*sizeof(*size));
|
||||
HDmemset(buf, 0, rows_at_once*sizeof(*buf));
|
||||
if (H5Rread(ra, row, rows_at_once, H_MTYPE, size,
|
||||
if (H5RAread(ra, row, rows_at_once, H_MTYPE, size,
|
||||
(void**)buf)<0) {
|
||||
goto error;
|
||||
}
|
||||
@ -470,7 +470,7 @@ ragged_read_short(hid_t ra, hsize_t rows_at_once, hsize_t width)
|
||||
|
||||
/* Read data */
|
||||
for (i=0; i<rows_at_once; i++) size[i] = width;
|
||||
if (H5Rread(ra, row, rows_at_once, H_MTYPE, size,
|
||||
if (H5RAread(ra, row, rows_at_once, H_MTYPE, size,
|
||||
(void**)buf)<0) {
|
||||
goto error;
|
||||
}
|
||||
@ -612,7 +612,7 @@ main(int argc, char *argv[])
|
||||
printf("Chunk size is %lu by %lu\n",
|
||||
(unsigned long)(ch_size[0]), (unsigned long)(ch_size[1]));
|
||||
if (H5Pset_chunk(dcpl, 2, ch_size)<0) goto error;
|
||||
if ((ra=H5Rcreate(file, "ra", H_FTYPE, dcpl))<0) goto error;
|
||||
if ((ra=H5RAcreate(file, "ra", H_FTYPE, dcpl))<0) goto error;
|
||||
if (H5Pclose(dcpl)<0) goto error;
|
||||
|
||||
/* The tests */
|
||||
@ -630,7 +630,7 @@ main(int argc, char *argv[])
|
||||
rand_nelmts(1);
|
||||
|
||||
/* Cleanup */
|
||||
if (H5Rclose(ra)<0) goto error;
|
||||
if (H5RAclose(ra)<0) goto error;
|
||||
if (H5Fclose(file)<0) goto error;
|
||||
|
||||
puts("All ragged array tests passed.");
|
||||
|
||||
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